O pastor Juan Marcos Vargas Samaniego nasceu no Paraguai. Em 1999, ele completou seu curso de Inglês no Caribbean Union College, afiliado à Andrews University em Trinidade e Tobago. Em 2007, formou-se em Teologia e Administração pelo Centro Universitário Adventista de São Paulo (Unasp), mesma instituição onde concluiu, em 2016, sua pós-graduação em Comunicação Empresarial. Nos últimos anos, realizou diversas especializações nas áreas de pré-produção, produção, pós-produção, fotografia e cinematografia. 

Iniciou seu ministério em 2007 como pastor em diversos distritos pastorais do estado do Maranhão. Neste mesmo estado, atuou como diretor de Multimídia e Comunicação da Associação Maranhense, em São Luís (MA). Atualmente, trabalhava como diretor de Comunicação da União Paraguaia e diretor da Rádio Nuevo Tiempo em Assunção, capital paraguaia. O pastor Juan Vargas é casado com Jaqueline Vargas e tem dois filhos: Jonathan Brian e Julia Yasmín.